Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sema3fO88632 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms