Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sap30O88574 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sap30O88574 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sap30O88574 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sap30O88574 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sap30O88574 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sap30O88574 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sap30O88574 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sap30O88574 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sap30O88574 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sap30O88574 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sap30O88574 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sap30O88574 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sap30O88574 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sap30O88574 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sap30O88574 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sap30O88574 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sap30O88574 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sap30O88574 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sap30O88574 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sap30O88574 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sap30O88574 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sap30O88574 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sap30O88574 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sap30O88574 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sap30O88574 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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