Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn2O88552 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn2O88552 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn2O88552 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn2O88552 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn2O88552 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn2O88552 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn2O88552 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn2O88552 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn2O88552 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn2O88552 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn2O88552 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn2O88552 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms