Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms