Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad51dO55230 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms