Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx4O55187 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx4O55187 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms