Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NlkO54949 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NlkO54949 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NlkO54949 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NlkO54949 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NlkO54949 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NlkO54949 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NlkO54949 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NlkO54949 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NlkO54949 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NlkO54949 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NlkO54949 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NlkO54949 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NlkO54949 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NlkO54949 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NlkO54949 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NlkO54949 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NlkO54949 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NlkO54949 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NlkO54949 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NlkO54949 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NlkO54949 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NlkO54949 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NlkO54949 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NlkO54949 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NlkO54949 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NlkO54949 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NlkO54949 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NlkO54949 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NlkO54949 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NlkO54949 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NlkO54949 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NlkO54949 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NlkO54949 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NlkO54949 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NlkO54949 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NlkO54949 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NlkO54949 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NlkO54949 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NlkO54949 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NlkO54949 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NlkO54949 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NlkO54949 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NlkO54949 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NlkO54949 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NlkO54949 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NlkO54949 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NlkO54949 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NlkO54949 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NlkO54949 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NlkO54949 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NlkO54949 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NlkO54949 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NlkO54949 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NlkO54949 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NlkO54949 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NlkO54949 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NlkO54949 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NlkO54949 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NlkO54949 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NlkO54949 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NlkO54949 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NlkO54949 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NlkO54949 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NlkO54949 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NlkO54949 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NlkO54949 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NlkO54949 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NlkO54949 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NlkO54949 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NlkO54949 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NlkO54949 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NlkO54949 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NlkO54949 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NlkO54949 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NlkO54949 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NlkO54949 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NlkO54949 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NlkO54949 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NlkO54949 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NlkO54949 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NlkO54949 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NlkO54949 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NlkO54949 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NlkO54949 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NlkO54949 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NlkO54949 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NlkO54949 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NlkO54949 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NlkO54949 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NlkO54949 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NlkO54949 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NlkO54949 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NlkO54949 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NlkO54949 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NlkO54949 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NlkO54949 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NlkO54949 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NlkO54949 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NlkO54949 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms