Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EdaO54693 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EdaO54693 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EdaO54693 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EdaO54693 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EdaO54693 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EdaO54693 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EdaO54693 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EdaO54693 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EdaO54693 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EdaO54693 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EdaO54693 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EdaO54693 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EdaO54693 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EdaO54693 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EdaO54693 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EdaO54693 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EdaO54693 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EdaO54693 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EdaO54693 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EdaO54693 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EdaO54693 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EdaO54693 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EdaO54693 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EdaO54693 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EdaO54693 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EdaO54693 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EdaO54693 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EdaO54693 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EdaO54693 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EdaO54693 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EdaO54693 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EdaO54693 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EdaO54693 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EdaO54693 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EdaO54693 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EdaO54693 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EdaO54693 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EdaO54693 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EdaO54693 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EdaO54693 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EdaO54693 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EdaO54693 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EdaO54693 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EdaO54693 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EdaO54693 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EdaO54693 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EdaO54693 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EdaO54693 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EdaO54693 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EdaO54693 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EdaO54693 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EdaO54693 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EdaO54693 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EdaO54693 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EdaO54693 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EdaO54693 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EdaO54693 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EdaO54693 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EdaO54693 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EdaO54693 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EdaO54693 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EdaO54693 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EdaO54693 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EdaO54693 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EdaO54693 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EdaO54693 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EdaO54693 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EdaO54693 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EdaO54693 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EdaO54693 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EdaO54693 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EdaO54693 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EdaO54693 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EdaO54693 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EdaO54693 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EdaO54693 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EdaO54693 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EdaO54693 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EdaO54693 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EdaO54693 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EdaO54693 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EdaO54693 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EdaO54693 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EdaO54693 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EdaO54693 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EdaO54693 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EdaO54693 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EdaO54693 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EdaO54693 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EdaO54693 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EdaO54693 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EdaO54693 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EdaO54693 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EdaO54693 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EdaO54693 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EdaO54693 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EdaO54693 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EdaO54693 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EdaO54693 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms