Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per1O35973 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per1O35973 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Per1O35973 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per1O35973 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per1O35973 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per1O35973 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per1O35973 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per1O35973 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Per1O35973 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Per1O35973 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Per1O35973 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Per1O35973 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Per1O35973 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Per1O35973 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Per1O35973 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Per1O35973 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Per1O35973 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Per1O35973 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Per1O35973 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Per1O35973 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Per1O35973 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Per1O35973 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Per1O35973 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Per1O35973 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Per1O35973 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Per1O35973 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Per1O35973 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Per1O35973 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Per1O35973 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Per1O35973 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Per1O35973 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Per1O35973 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Per1O35973 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Per1O35973 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Per1O35973 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Per1O35973 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per1O35973 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per1O35973 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per1O35973 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per1O35973 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per1O35973 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per1O35973 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per1O35973 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per1O35973 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per1O35973 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per1O35973 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per1O35973 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Per1O35973 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Per1O35973 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Per1O35973 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Per1O35973 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Per1O35973 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Per1O35973 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Per1O35973 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Per1O35973 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Per1O35973 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Per1O35973 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Per1O35973 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Per1O35973 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Per1O35973 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Per1O35973 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Per1O35973 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Per1O35973 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Per1O35973 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Per1O35973 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Per1O35973 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Per1O35973 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Per1O35973 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Per1O35973 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Per1O35973 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Per1O35973 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Per1O35973 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Per1O35973 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Per1O35973 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Per1O35973 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Per1O35973 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Per1O35973 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Per1O35973 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Per1O35973 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Per1O35973 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Per1O35973 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Per1O35973 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Per1O35973 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Per1O35973 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Per1O35973 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Per1O35973 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Per1O35973 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Per1O35973 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Per1O35973 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Per1O35973 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Per1O35973 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Per1O35973 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Per1O35973 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Per1O35973 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Per1O35973 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Per1O35973 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Per1O35973 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Per1O35973 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Per1O35973 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms