Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpibO35906 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpibO35906 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpibO35906 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SpibO35906 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpibO35906 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SpibO35906 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SpibO35906 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SpibO35906 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SpibO35906 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SpibO35906 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SpibO35906 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SpibO35906 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SpibO35906 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SpibO35906 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SpibO35906 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpibO35906 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpibO35906 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpibO35906 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpibO35906 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpibO35906 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpibO35906 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SpibO35906 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpibO35906 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpibO35906 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SpibO35906 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SpibO35906 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SpibO35906 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SpibO35906 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SpibO35906 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SpibO35906 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SpibO35906 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SpibO35906 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SpibO35906 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SpibO35906 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SpibO35906 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SpibO35906 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SpibO35906 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SpibO35906 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SpibO35906 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpibO35906 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SpibO35906 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SpibO35906 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SpibO35906 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SpibO35906 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SpibO35906 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SpibO35906 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SpibO35906 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SpibO35906 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SpibO35906 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SpibO35906 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SpibO35906 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SpibO35906 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SpibO35906 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SpibO35906 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpibO35906 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpibO35906 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpibO35906 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SpibO35906 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpibO35906 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SpibO35906 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpibO35906 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpibO35906 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpibO35906 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpibO35906 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpibO35906 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpibO35906 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpibO35906 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpibO35906 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpibO35906 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpibO35906 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpibO35906 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpibO35906 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SpibO35906 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SpibO35906 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SpibO35906 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SpibO35906 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SpibO35906 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SpibO35906 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SpibO35906 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SpibO35906 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SpibO35906 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SpibO35906 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms