Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops5O35864 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops5O35864 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops5O35864 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops5O35864 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cops5O35864 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cops5O35864 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops5O35864 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops5O35864 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms