Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf9O35739 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf9O35739 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf9O35739 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf9O35739 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf9O35739 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf9O35739 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms