Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppfibp2O35711 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms