Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold2O35654 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold2O35654 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold2O35654 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pold2O35654 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold2O35654 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold2O35654 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold2O35654 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold2O35654 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold2O35654 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold2O35654 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold2O35654 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pold2O35654 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pold2O35654 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pold2O35654 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pold2O35654 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pold2O35654 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pold2O35654 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pold2O35654 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pold2O35654 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pold2O35654 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pold2O35654 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pold2O35654 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pold2O35654 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pold2O35654 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms