Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npc1O35604 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Npc1O35604 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npc1O35604 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npc1O35604 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Npc1O35604 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npc1O35604 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npc1O35604 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Npc1O35604 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npc1O35604 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Npc1O35604 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms