Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Opn1mwO35599 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn1mwO35599 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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