Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Xbp1O35426 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Xbp1O35426 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xbp1O35426 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Xbp1O35426 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Xbp1O35426 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Xbp1O35426 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xbp1O35426 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xbp1O35426 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Xbp1O35426 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xbp1O35426 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Xbp1O35426 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xbp1O35426 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Xbp1O35426 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xbp1O35426 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xbp1O35426 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xbp1O35426 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xbp1O35426 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xbp1O35426 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xbp1O35426 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Xbp1O35426 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xbp1O35426 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Xbp1O35426 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xbp1O35426 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xbp1O35426 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Xbp1O35426 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xbp1O35426 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xbp1O35426 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xbp1O35426 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xbp1O35426 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xbp1O35426 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xbp1O35426 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xbp1O35426 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xbp1O35426 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Xbp1O35426 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xbp1O35426 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xbp1O35426 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xbp1O35426 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xbp1O35426 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Xbp1O35426 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xbp1O35426 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xbp1O35426 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xbp1O35426 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xbp1O35426 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xbp1O35426 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xbp1O35426 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xbp1O35426 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Xbp1O35426 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xbp1O35426 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xbp1O35426 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Xbp1O35426 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Xbp1O35426 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xbp1O35426 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Xbp1O35426 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xbp1O35426 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Xbp1O35426 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Xbp1O35426 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Xbp1O35426 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Xbp1O35426 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xbp1O35426 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms