Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms