Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx3O35160 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms