Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Polr1aO35134 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Polr1aO35134 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Polr1aO35134 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms