Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LhbO09108 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LhbO09108 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LhbO09108 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LhbO09108 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LhbO09108 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LhbO09108 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LhbO09108 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LhbO09108 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LhbO09108 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LhbO09108 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LhbO09108 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LhbO09108 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LhbO09108 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LhbO09108 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LhbO09108 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LhbO09108 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LhbO09108 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LhbO09108 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LhbO09108 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LhbO09108 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LhbO09108 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LhbO09108 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LhbO09108 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LhbO09108 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LhbO09108 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LhbO09108 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LhbO09108 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LhbO09108 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LhbO09108 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LhbO09108 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LhbO09108 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LhbO09108 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LhbO09108 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LhbO09108 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LhbO09108 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LhbO09108 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LhbO09108 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LhbO09108 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LhbO09108 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LhbO09108 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LhbO09108 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LhbO09108 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LhbO09108 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LhbO09108 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LhbO09108 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LhbO09108 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LhbO09108 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LhbO09108 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LhbO09108 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LhbO09108 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LhbO09108 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LhbO09108 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LhbO09108 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LhbO09108 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LhbO09108 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LhbO09108 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LhbO09108 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LhbO09108 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LhbO09108 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LhbO09108 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LhbO09108 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LhbO09108 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LhbO09108 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LhbO09108 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LhbO09108 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LhbO09108 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LhbO09108 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LhbO09108 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LhbO09108 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LhbO09108 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LhbO09108 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LhbO09108 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LhbO09108 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LhbO09108 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LhbO09108 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LhbO09108 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LhbO09108 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LhbO09108 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LhbO09108 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LhbO09108 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LhbO09108 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LhbO09108 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LhbO09108 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LhbO09108 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LhbO09108 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LhbO09108 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LhbO09108 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LhbO09108 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LhbO09108 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LhbO09108 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LhbO09108 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LhbO09108 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LhbO09108 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LhbO09108 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LhbO09108 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LhbO09108 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LhbO09108 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LhbO09108 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LhbO09108 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms