Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dctn1O08788 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms