Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcof1O08784 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcof1O08784 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms