Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CltaO08585 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CltaO08585 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CltaO08585 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CltaO08585 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CltaO08585 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CltaO08585 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CltaO08585 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CltaO08585 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CltaO08585 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CltaO08585 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CltaO08585 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CltaO08585 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CltaO08585 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CltaO08585 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CltaO08585 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CltaO08585 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CltaO08585 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CltaO08585 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CltaO08585 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CltaO08585 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CltaO08585 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltaO08585 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltaO08585 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltaO08585 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltaO08585 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CltaO08585 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CltaO08585 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CltaO08585 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CltaO08585 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CltaO08585 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CltaO08585 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CltaO08585 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CltaO08585 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CltaO08585 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CltaO08585 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CltaO08585 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CltaO08585 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CltaO08585 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CltaO08585 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CltaO08585 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CltaO08585 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CltaO08585 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CltaO08585 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CltaO08585 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CltaO08585 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CltaO08585 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CltaO08585 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CltaO08585 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CltaO08585 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CltaO08585 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CltaO08585 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CltaO08585 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CltaO08585 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CltaO08585 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CltaO08585 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CltaO08585 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CltaO08585 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CltaO08585 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CltaO08585 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CltaO08585 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CltaO08585 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CltaO08585 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CltaO08585 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CltaO08585 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CltaO08585 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CltaO08585 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CltaO08585 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CltaO08585 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CltaO08585 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CltaO08585 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CltaO08585 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CltaO08585 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CltaO08585 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CltaO08585 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CltaO08585 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CltaO08585 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CltaO08585 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CltaO08585 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CltaO08585 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CltaO08585 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CltaO08585 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CltaO08585 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CltaO08585 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CltaO08585 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CltaO08585 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CltaO08585 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CltaO08585 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CltaO08585 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CltaO08585 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CltaO08585 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CltaO08585 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CltaO08585 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CltaO08585 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CltaO08585 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CltaO08585 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CltaO08585 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CltaO08585 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CltaO08585 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CltaO08585 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms