Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp955bL7N232 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms