Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r80L7N1Z3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r80L7N1Z3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.8 ms