Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20918J3QN17 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms