Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp870J3QMA4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp870J3QMA4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp870J3QMA4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp870J3QMA4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp870J3QMA4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
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Zfp870J3QMA4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp870J3QMA4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp870J3QMA4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp870J3QMA4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp870J3QMA4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Zfp870J3QMA4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
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Zfp870J3QMA4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Zfp870J3QMA4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Zfp870J3QMA4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp870J3QMA4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Zfp870J3QMA4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Zfp870J3QMA4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Zfp870J3QMA4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Zfp870J3QMA4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Zfp870J3QMA4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp870J3QMA4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms