Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm21969J3QJZ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm21969J3QJZ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm21969J3QJZ1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm21969J3QJZ1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm21969J3QJZ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm21969J3QJZ1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm21969J3QJZ1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm21969J3QJZ1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm21969J3QJZ1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm21969J3QJZ1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm21969J3QJZ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm21969J3QJZ1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm21969J3QJZ1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm21969J3QJZ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm21969J3QJZ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm21969J3QJZ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm21969J3QJZ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm21969J3QJZ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms