Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21060J3KMU4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21060J3KMU4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21060J3KMU4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21060J3KMU4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21060J3KMU4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21060J3KMU4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21060J3KMU4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21060J3KMU4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21060J3KMU4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21060J3KMU4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21060J3KMU4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21060J3KMU4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21060J3KMU4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21060J3KMU4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21060J3KMU4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21060J3KMU4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21060J3KMU4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms