Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21411J3KMS0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
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