Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933406M09RikG3XA12 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933406M09RikG3XA12 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms