Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3tc1G3X9F6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3tc1G3X9F6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms