Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nccrp1G3X9C2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nccrp1G3X9C2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nccrp1G3X9C2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nccrp1G3X9C2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nccrp1G3X9C2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nccrp1G3X9C2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nccrp1G3X9C2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nccrp1G3X9C2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nccrp1G3X9C2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nccrp1G3X9C2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nccrp1G3X9C2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nccrp1G3X9C2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nccrp1G3X9C2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nccrp1G3X9C2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms