Protein–RNA interactions for Protein: G3UXE9

Gm8909, Predicted gene 8909, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8909G3UXE9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8909G3UXE9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8909G3UXE9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8909G3UXE9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8909G3UXE9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8909G3UXE9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm8909G3UXE9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8909G3UXE9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms