Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx1-1G3UXB3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nkx1-1G3UXB3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nkx1-1G3UXB3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms