Protein–RNA interactions for Protein: F8VQG7

N4bp2, NEDD4-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp2F8VQG7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
N4bp2F8VQG7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
N4bp2F8VQG7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
N4bp2F8VQG7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4bp2F8VQG7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4bp2F8VQG7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4bp2F8VQG7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4bp2F8VQG7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4bp2F8VQG7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4bp2F8VQG7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4bp2F8VQG7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4bp2F8VQG7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4bp2F8VQG7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
N4bp2F8VQG7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms