Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srp72F8VQC1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp72F8VQC1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms