Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Vmn1r76F8VQ63 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.6 ms