Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5830473C10RikF8VQ07 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5830473C10RikF8VQ07 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms