Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
BicraF8VPZ9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
BicraF8VPZ9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
BicraF8VPZ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
BicraF8VPZ9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222.9 ms