Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
D430041D05RikF6ZGR6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms