Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8005F6YKY3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms