Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21970F6XX07 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms