Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm8247F6VRJ8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms