Protein–RNA interactions for Protein: F6RSK3

Gm17430, Predicted gene, 17430, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17430F6RSK3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17430F6RSK3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17430F6RSK3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17430F6RSK3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17430F6RSK3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms