Protein–RNA interactions for Protein: F6R5P4

Ccl17, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl17F6R5P4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl17F6R5P4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl17F6R5P4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl17F6R5P4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl17F6R5P4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms