Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmod3E9QA62 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmod3E9QA62 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms