Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3hdm1E9Q9Q2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3hdm1E9Q9Q2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3hdm1E9Q9Q2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.2 ms