Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5407E9Q7Q1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5407E9Q7Q1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms